Liebe Task-Force Mitglieder, erst einmal ein schönes neues! Leider ist es etwas ruhig geworden in unserer Task Force, da mir andere Aktivitäten die Zeit geraubt haben. Mittlerweile habe ich schon mal alle mir bekannten Infos/Ressourcen zum Theme Executable Papers in das Dokument in GitHub Gruppe eingefügt: https://github.com/TF-Executable-Papers/Documents Ich würde nun jeweils Euch noch einmal alle bitten, bis zum 15.03. über die Mailingliste alle Projekte, Literatur, Software, Guidelines, Publikations(organe) u. ä. zu schicken, die Euch bekannt sind und für Executable Papers relevant/hilfreich sein könnten. Ich würde die Infos danach in das Dokument auf GitHub einpflegen. Im Anschluss organisiere ich dann ein weiteres virtuelles Treffen, auf dem wir das ganze auswerten und den nächsten Schritt besprechen können. Für relevante Literaturquellen habe ich ebenfalls eine Zoterogruppe erstellt, zu der ich Euch, sofern es in den nächsten Tagen keinen Einspruch gibt, alle einladen würde: https://www.zotero.org/groups/4960368/dhd_task_force_executable_papers/ (die Literatur auf GitHub sind aus dieser Gruppe gespiegelt). Lasst uns die Task-Force dieses Jahr ein bisschen mit Leben füllen 😉 Herzlichst, Niels-Oliver [cid:5c71a48c-25ea-4d72-b882-166cd1ec4ad1] ____ Niels-Oliver WALKOWSKI Research scientist for digital literacy and research FHSE - Melusina Press UNIVERSITÈ DU LUXEMBOURG Belval Campus 11, Porte des Sciences L-4366 Esch-sur-Alzette T +352 46 66 44 4937 niels-oliver.walkowski@uni.lumailto:niels-oliver.walkowski@uni.lu / www.uni.luhttp://www.uni.lu/ / www.melusinapress.luhttp://www.melusinapress.lu/
Hallo, Mittlerweile habe ich schon mal alle mir bekannten Infos/Ressourcen zum Theme Executable Papers in das Dokument in GitHub Gruppe eingefügt: https://github.com/TF-Executable-Papers/Documents Prima, dankeschön! Ich würde nun jeweils Euch noch einmal alle bitten, bis zum 15.03. über die Mailingliste alle Projekte, Literatur, Software, Guidelines, Publikations(organe) u. ä. zu schicken, die Euch bekannt sind und für Executable Papers relevant/hilfreich sein könnten. Ich würde die Infos danach in das Dokument auf GitHub einpflegen. Im Anschluss organisiere ich dann ein weiteres virtuelles Treffen, auf dem wir das ganze auswerten und den nächsten Schritt besprechen können. Veröffentlichungen zum Thema Jupyter und Reproduzierbarkeit and executable papers: [Beg2021] Marijan Beg; Juliette Belin; Thomas Kluyver; Alexander Konovalov; Min Ragan-Kelley; Nicolas Thiery; Hans Fangohr. "Using Jupyter for Reproducible Scientific Workflows", Computing in Science & Engineering, vol. 23, no. 2, pp. 36-46, 1 March-April 2021, doi: 10.1109/MCSE.2021.3052101https://doi.org/10.1109/MCSE.2021.3052101 arXiv preprinthttps://arxiv.org/abs/2102.09562 (2021) [Fangohr2020] Hans Fangohr, Marijan Beg, Martin Bergemann, Valerii Bondar, Sandor Brockhauser, Camille Carinan, Raul Costa, et al, "Data exploration and analysis with Jupyter notebooks", Proceedings of the 17th International Conference on Accelerator and Large Experimental Physics Control Systems ICALEPCS2019, TUCPR02 http://accelconf.web.cern.ch/icalepcs2019/doi/JACoW-ICALEPCS2019-TUCPR02.htm..., pdfhttps://jacow.org/icalepcs2019/papers/tucpr02.pdf (2020) [Granger2021] Brian Granger, Fernando Pérez. "Jupyter: Thinking and Storytelling With Code and Data." Computing in Science & Engineering, vol. 23, no. 2, pp. 7-14, 1 March-April 2021, doi: 10.1109/MCSE.2021.3059263https://doi.org/10.1109/MCSE.2021.3059263 Authorea preprinthttps://www.authorea.com/doi/full/10.22541/au.161298309.98344404/v2 (2021) All references above taken from https://fangohr.github.io/blog/jupyter-for-computational-science-and-data-sc... (URLs should work there if not in the snippet copied and pasted above). Related software: “NBVAL” - treat a Jupyter Notebook with output cells as a regression test: every cell is a test. Pass if re-computed output matches output saved on disk, otherwise fail. More fine tuning is possible. Documentation: Veröffentlichungen zum Thema Jupyter und Reproduzierbarkeit and executable papers: More detailed report: Testing with Jupyter notebooks: NoteBook VALidation (nbval) plug-in for pytest, Hans Fangohr, Vidar Fauske, Thomas Kluyver, Maximilian Albert, Oliver Laslett, David Cortés-Ortuño, Marijan Beg, Min Ragan-Kelly, https://arxiv.org/abs/2001.04808 (2020) Best wishes, Hans
Hallo,
vielen Dank für die Hinweise. Ich werde sie gebündelt zusammen mit den noch kommenden Mails einpflegen.
Einen schönen Wochenstart.
Herzlichst,
Niels-Oliver
[cid:1b5195ca-200f-4260-83a0-7d1bb67d6e74]
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Niels-Oliver WALKOWSKI
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Von: Fangohr, Hans
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